Dados › Amostra Nexus 5%

Base OMOP CDM v5.3 para aprender e praticar

Amostra Nexus 5% — dados reais desidentificados do SUS em OMOP CDM

Uma amostra aleatória de 5% dos pacientes da coorte Nexus (~445 mil pessoas, 2012–2025), em 10 tabelas clínicas do OMOP CDM v5.3. Para quem quer aprender e praticar OMOP com as ferramentas da OHDSI — ATLAS, HADES, DQD, pacotes R e Python — com dados de verdade, sem fins comerciais.

O que tem na amostra

Registros reais e desidentificados — não é uma base sintética. A coorte Nexus nasce do linkage determinístico dos sistemas ambulatorial (SIA) e hospitalar (SIH) do SUS, descrito em Pharmacoepidemiology and Drug Safety (2026); esta amostra é um recorte aleatório de ~5% dos seus pacientes, padronizado para o OMOP CDM v5.3 com vocabulários OMOP (CID-10 → SNOMED, SIGTAP → procedimentos e medicamentos).

  • 10 tabelas clínicas: personobservation_periodvisit_occurrencecondition_occurrenceprocedure_occurrencedrug_exposuredevice_exposuremeasurementobservationdeath
  • Formato: um arquivo Parquet (zstd) por tabela, lido direto por DuckDB, Arrow/R, Spark e pandas; manifesto com contagens, período e SHA-256; README com receitas para DuckDB, R e ATLAS (Broadsea).
  • Desidentificação: sem identificadores diretos; IDs opacos; data de nascimento padronizada em 1º de janeiro do ano (use só year_of_birth); location, care_site, provider e note excluídas; datas dos eventos clínicos mantidas.
  • Vocabulários: não incluídos — baixe gratuitamente no OHDSI Athena (a versão de origem está no manifesto).
  • Limites: a coorte Nexus é uma subpopulação selecionada (enriquecida em cuidado especializado) e esta é uma amostra de 5% dela — serve para aprender, testar ETL e praticar análises longitudinais, não para inferência populacional, incidência/prevalência ou decisão clínica.
  • Licença: Termos de Uso de Dados (uso educacional e não comercial; sem reidentificação; sem redistribuição; atribuição). O aceite é registrado antes de gerar os links. Para uso comercial ou a coorte completa, fale com a gente.
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Depois do download, oferecemos 30 min de "OMOP office hours" com um epidemiologista da Precision Data.
Cite a fonte
Oliveira JCB, Sarmento TTR, Rocha DMUP, et al. Nexus: A Deterministic Linkage Framework for Constructing Longitudinal Real-World Data in Brazil's Public Health System. Pharmacoepidemiol Drug Saf. 2026;35(6):e70391. doi:10.1002/pds.70391
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